2月27日起，對于自營商品配送，注冊會員、銅牌會員、銀牌會員和金牌會員的訂單金額(按減去直降和返現促銷的金額)必須不低于59元才能免運費，企業會員、鉆石會員的則不能低于39元，否則加收5元運費。
　　
　　此外，部分商品配送至西藏、新疆等偏遠地區時(以京東公示區域為準)，還會額外收取運費10元/件。而小額訂單則不再免運費，即使高級鉆石會員也不行。另外，極速達服務收費依舊是49元。
　　
　　事實上，這并不是京東商城首次對運費進行調整。京東商城剛剛上線時，實行的是全場免運費。不過在2011年11月，京東商城將免運費金額提升至39元。如今，則再次將免運費金額由39元提升至59元。
　　
　　提升免運費金額，對于京東而言，實際上就是幫助京東縮減物流成本，進一步提高毛利率，這對于IPO在即的京東而言是相當重要的。不過從消費者的角度來說，京東此舉無疑是增加了消費者的消費成本，自然消費者會產生不滿的情緒。今日，便有網友評論稱，難道是劉強東燒不起錢了，所以要大幅上漲免運費金額？另外，也有網友認為，京東通過免運費等方式積累了一定用戶基數后，便選擇上漲免運費金額，大有坐地起價、綁架消費者之嫌。